Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20517G3UVU6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms