Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usp9yF8VPU6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp9yF8VPU6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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