Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Arid4aF8VPQ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arid4aF8VPQ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms