Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm28038F7BCN9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm28038F7BCN9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm28038F7BCN9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gm28038F7BCN9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gm28038F7BCN9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gm28038F7BCN9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm28038F7BCN9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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