Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gm20538F6Z9R1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms