Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SmgcF6VRN1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms