Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atf6F6VAN0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atf6F6VAN0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms