Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn5F6UCX4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms