Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm28305F6U473 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms