Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms