Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Susd1E9Q3H4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Susd1E9Q3H4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms