Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms