Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Ccdc171E9Q1U1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc171E9Q1U1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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