Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc17E9PVB5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms