Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klhl3E0CZ16 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms