Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tgfbr3lD3YZZ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms