Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Catsperg2C6KI89 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Catsperg2C6KI89 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms