Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm20547B8JJN0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm20547B8JJN0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm20547B8JJN0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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