Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Apol6B7ZC55 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms