Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cfap58B2RW38 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms