Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5483B2RV77 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms