Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brpf3B2KF05 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms