Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb8B1AY40 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ssxb8B1AY40 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb8B1AY40 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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