Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms