Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skint8A7XV07 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms