Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm11127A7VMS2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm11127A7VMS2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm11127A7VMS2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm11127A7VMS2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm11127A7VMS2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm11127A7VMS2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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