Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Atp8b5A3FIN4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp8b5A3FIN4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp8b5A3FIN4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms