Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palm3A2TJV2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palm3A2TJV2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms