Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39aA2ACP1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39aA2ACP1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms