Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm16A2A935 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms