Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtprfA2A8L5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms