Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdc27A2A6Q5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms