Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc173A0JLY1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc173A0JLY1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms