Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrit3W8DXL4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrit3W8DXL4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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