Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Speer3W4VSP1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Speer3W4VSP1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms