Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb2S4R1M3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afb2S4R1M3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms