Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vamp5Q9Z2P8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Vamp5Q9Z2P8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vamp5Q9Z2P8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms