Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms