Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccne2Q9Z238 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccne2Q9Z238 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms