Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HnrnpcQ9Z204 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms