Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Syngr4Q9Z1L2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Syngr4Q9Z1L2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms