Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sh3bp5Q9Z131 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5Q9Z131 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Sh3bp5Q9Z131 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Sh3bp5Q9Z131 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sh3bp5Q9Z131 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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