Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn3Q9WUK7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms