Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms