Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms