Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp11cQ9QZW0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp11cQ9QZW0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms