Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms