Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Six6Q9QZ28 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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