Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Irx4Q9QY61 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx4Q9QY61 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms