Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Kcnip3Q9QXT8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Kcnip3Q9QXT8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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